自成立至今，团队系统建立了单细胞生物分离鉴定、功能基因组实验和计算平台。具有微藻、微生物培养、分离、表征、改良与基因组数据分析的软硬件条件，为单细胞生物工程细胞制造以及表型和基因型解析提供了条件。具体分述如下：
细胞培养：（1）专门用于藻类培养的反应器、培养罐、培养柜、恒温室和人工气候培养箱；（2）自行设计的、光强可控的强光型光生物反应器，为表型和基因型的深度解析提供样品来源。（3）藻种低温保存展示柜：可批量保存工程细胞。（4）-80 °C冰箱：可批量保存各种菌种和质粒。
遗传工程平台：（1）高通量组织研磨仪：可快速高通量制备突变子gDNA和RNA，便于突变子筛选和基因型鉴定；（2）DNA、RNA操作技术平台：BioRad和Eppendoff 梯度PCR仪、荧光定量PCR仪和核酸定量分析用的GeneQuant TM 1300紫外分光光度计；（3）可用于基因组改造的Bio-Rad Gene Pulser Xcell电穿孔完全系统，为基因型解析和遗传工程改良等奠定了基础。(4) 蛋白分析平台：蓝温胶电泳、SDS-PAGE和一体化蛋白免疫印迹系统Amersham WB。
表型分析平台：（1）显微观察的生物显微镜、倒置生物显微镜和荧光显微镜等。（2）用于生长速率监测的GeneQuant TM 1300紫外分光光度计（OD测定）和0.01 mg电子天平（细胞干重测定）。
光合生理分析平台：（1）对呼吸速率和光合参数进行测定的CHLOROLAB 2液相氧电极、叶绿素荧光成像系统Imaging-PAM和Dual-PAM100等；（2）对光合色素（叶绿素、类胡萝卜素）定性和定量检测用的GeneQuant 1300、岛津分光光度计、超低温荧光发射光谱检测用的日立紫外可见分光光度计F-4600系统等。
代谢物分析平台：包括项目组只有的对关键蛋白和代谢物进行监控的TLC和GC-MS技术平台等仪器。
同时依托于南海海洋资源利用国家重点实验室，团队用于单细胞生物生理学、分子生物学、遗传工程、细胞定向进化、表型与基因型解析的全部软硬件平台。